分子筛效应是当含有多种分子成分的样品溶液缓慢地流经凝 胶色谱柱时，各分子在柱内同时进行着两种 不同的运动，垂直向下的移动和无定向的扩 散运动。大分子物质由于直径较大，不易进 入凝胶颗粒的微孔中，而分布于颗粒之间， 在洗脱时移动的速度较快；小分子物质除了 可在凝胶颗粒间隙中扩散外，还可以进入凝胶颗粒的微孔中，即进入凝胶相内，在向下 移动的过程中，从一个凝胶内扩散到颗粒间 隙后再进入另一凝胶颗粒，如此不断地进入和扩散，因此，小分子物质的下移速度要落后于大分子物质，从而使样品中分子大的先 流出色谱柱，中等分子的后流出，分子最小 的最后流出，这种现象叫分子筛效应。
    一个含有各种分子的样品溶液缓慢地流经凝胶色谱柱时，各分子在柱内同时进行着两种不同的运动：垂直向下的移动和无定向的扩散运动。大分子物质由于直径较大，不易进入凝胶颗粒的微孔，而只能分布颗粒之间，所以在洗脱时向下移动的速度较快。小分子物质除了可在凝胶颗粒间隙中扩散外，还可以进入凝胶颗粒的微孔中，即进入凝胶相内，在向下移动的过程中，从一个凝胶内扩散到颗粒间隙后再进入另一凝胶颗粒，如此不断地进入和扩散，小分子物质的下移速度落后于大分子物质，从而使样品中大的分子先流出色谱柱，中等的分子后流出，小分子最后流出，这种现象叫分子筛效应。
    具有多孔的凝胶就是分子筛。各种分子筛的孔隙大小分布有一定范围，有最大极限和最小极限。分子直径比凝胶最大孔隙直径大的，就会全部被排阻在凝胶颗粒之外，这种情况叫全排阻。两种全排阻的分子即使大小不同，也不能有分离效果。直径比凝胶最小孔直径小的分子能进入凝胶的全部孔隙。如果两种分子都能全部进入凝胶孔隙，即使它们的大小有差别，也不会有好的分离效果。因此，一定的分子筛有它一定的使用范围。